La Institución Educativa Monseñor Francisco Cristóbal Toro fue fundada en el año de 1925 con el nombre de Escuela Berlín; posteriormente se le asignó el nombre de Escuela La Arboleda.
En 1959 con la Ordenanza departamental 21 se le otorgó el nombre de Escuela De Niñas Monseñor Francisco Cristóbal Toro, en honor al Obispo, ilustre prelado que nació en Santa Fé de Antioquia el 11 de Abril de 1889. La Institución comenzó con los grados de 1 a 5, más adelante se creó el nivel preescolar. En 1998 según las Resoluciones 002057 de 1998 y 10789 de 2001 se convierte en Colegio Monseñor Francisco Cristóbal Toro, iniciando el ciclo de Educación Básica secundaria con el grado sexto, avanzando progresivamente hasta el grado noveno con proyección a la media vocacional.
Posteriormente conforme a las disposiciones de la Ley 715 de 2001 y específicamente por la Resolución Departamental 16212 de Noviembre 27 de 2002 se convierte en la Institución Educativa Monseñor Francisco Cristóbal Toro, asumiendo la fusión de las secciones: Escuela Epifanio Mejía y Escuela Ana Frank. Por último con la Resolución 311 de noviembre 27 de 2003 se autoriza y legaliza el nivel de Educación Media Académica y en 2013 se aprobó la media Técnica.
